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Notre laboratoire (Biophysique, Unité CNRS puis Inserm) utilise l'Ultra-Centrifugation Analytique (UCA) depuis plus de 25 ans afin d’étudier les protéines et leurs processus auto-associatifs. Nous avons ainsi analysé le processus de formation de polymères en forme d’anneau de la tubuline après le clivage protéolytique ménagé des domaines C-terminal des deux chaînes alpha et beta tubuline par la subtilisine (Peyrot et al., 1990;. Peyrot et al., 1991). La formation de polymère de tubuline induit par un anti-cancéreux la cryptophycine 52 (Barbier et al., 2001) a été également largement caractérisée. Nous avons appliqué l'UCA à l'interaction entre la protéine tau et microtubules (Devred et al., 2004, Amniai et al 2009, Gigant et al., 2014) et aussi, associée aux techniques de microcalorimétrie, sur les interactions de Stathmine-tubuline (Devred et al., 2008, Barbier et al., 2010). La question des états d'oligomérisation de HSP90 et ses complexes multiprotéiques (Garnier et al., 2002, Moullintraffort et al., 2010, Lepvrier et al., 2015); ceux de protéines virale du virus Nipah (NiV) (Blocquel et al., 2013 ; Bertrandi et al., 2015) ainsi que l'interaction entre le type cytochrome C3 I et II (Pieulle et al., 2005) ont été abordés par UCA.

L'UltraCentrifugation Analytique (UCA) étudie le comportement des macromolécules  natives  et en solution aqueuse, soumises à une force centrifuge. A l’aide d’un système de détection qui permet de mesurer la concentration en macromolécule en fonction du rayon de centrifugation, nous pouvons effectuer deux types d’expériences qui vont conduire à l’obtention d’informations complémentaires:

La vitesse de sédimentation permet d’obtenir le coefficient de sédimentation, la forme, l’état associatif (monomère, dimère, trimère,…) d’une macromolécule. Elle peut aussi mettre en évidence la formation d’un complexe et permettre la détermination de sa constante d’affinité.

L’équilibre de sédimentation permet d’obtenir la masse, l’état associatif (monomère, dimère, trimère,…) et de mettre en évidence la formation d’un complexe macromoléculaire.

MEMBRES

Titulaires / Permanents

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Nom
Prénom
Diane
Nom
ALLEGRO
Fonction
Fonction
Assistante Ingénieur
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Nom
Prénom
Pascale
Nom
BARBIER
Fonction
Fonction
Directeur de l'Unité - MCU
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Prénom
Vincent
Nom
PEYROT
Fonction
Fonction
Professeur
0

PUBLICATIONS RECENTES

  • Beltrandi, M. Blocquel, D. Eralesa,J. Barbier P. Cavalli A. Longhi, S. Insights into the coiled-coil organization of the Hendra virus phosphoprotein from combined biochemical and SAXS studies. (2015), Virology 477:42–55.
  • Blocquel D., Beltrandi M., Erales J. Barbier P, Longhi S. Biochemical and structural studies of the oligomerization domain of the Nipah virus phosphoprotein: evidence for an elongated coiled-coil homotrimer. Virology. (2013) 446(1–2): 162-72.
  • Barbier P, Dorleans A, Devred F, Sanz L, Allegro D, Alfonso C, Knossow M, Peyrot V, Andreu JM. Stahtmine and interfacial microtubules inhibitors recognize a naturally curved conformation of tubulin dimers. Journal of biological Chemistry, (2010) 285(41):31672-81.
  • Devred F, Barbier P, Lafitte D, Landrieu I, Lippens G, Peyrot V. Microtubule and MAPs: thermodynamics of complex formation by AUC, ITC, fluorescence, and NMR. Methods in Cellular Biology (2010);95:449-80.